مدرسه علمیه حضرت آیه الله العظمی آقای حاج سید محمد باقر خوانساری قدس سره فرزند برومند مرجع عالیقدر مجاهد مرحوم آیه الله العظمی آقای حاج سید محمد تقی خوانساری اعلی الله مقامه الشریف وقف شرعی مؤبد است برای آقایان طلاب شیعه اثنی عشری که به تحصیل علوم حوزوی مشغول بوده و ضوابط و مقررات تعیین شده از سوی تولیت مدرسه و نیز دستورالعمل‌های شورای عالی حوزه را دقیقاً رعایت نمایند.